인천의 국가지정 자연유산 보호수는 강화 갑곶리 탱자나무, 강화 사기리 탱자나무, 강화 볼음도 은행나무, 참성단 소사나무, 서구 신현동 회화나무, 대청도 동백나무 자생 북한지, 최근에는 남동구에 있는 장수동 은행나무가 자연유산으로 지정됐다.

강화 갑곶리 탱자나무의 수령은 400년이며 나무의 크기는 높이가 4.2m, 지상부의 줄기 둘레는 2.12m이다.
강화도는 탱자나무가 살아남을 수 있는 가장 북쪽의 한계지(限界地)이다. 강화도 참성단 소사나무는 2009년에 국가지정 자연유산으로 지정돼 보호받고 있다.

참성단 소사나무는 전형적인 관목에 나무갓이 단정하고 균형 잡혀 있으며 참성단의 돌단 위에 홀로 자리하기 때문에 한눈에 들어오며, 소사나무 특유의 고고함이 돋보인다.

소사나무는 서해안 섬에서 자생하며, 어렵지 않게 볼 수 있다. 단군의 제단과 우리 민족의 정기가 있는 곳에서 자라는 참성단 소사나무는 수려함을 넘어 고고한 매력을 풍기며, 규모와 아름다움에서 우리나라 소사나무를 대표한다고 볼 수 있다.

소사나무는 잎이 작고 줄기가 고목의 모습으로 예부터 분재 소재로 사랑을 받아온 대표적인 전통나무이다.
인천의 경우 영흥도 십리포, 백아도, 굴업도 등 해안주변에서 커다란 군락을 이루며 자라고 있다. 잎과 열매이삭이 큰 것을 왕소사나무라고 하며, 한 꽃이삭에 꽃이 많이 달리는 섬소사나무는 한국 특산종이다. 

강화 볼음도 은행나무는 나이가 약 900살 정도이고, 높이는 24m, 가슴높이 둘레는 8.96m이다. 볼음도 마을을 지켜주고 보호해주는 성황목이다. 900년 전 황해도 연안군 호남리에서 큰 홍수가 나 볼음도로 떠내려 온 나무를 주민들이 심은 것이라고 전해진다.
북한의 천연기념물 165호가 볼음도 은행나무의 헤어진 부인이라고 전해진다. 

인천 서구 신현동에 가면 400여년 된 회화나무를 만날 수 있다. 신현동 회화나무는 높이가 22m, 가슴둘레가 6m로 가지는 사방으로 길게 뻗어 있다. 
오랜 세월 신현동 주민들에게 사랑을 받아왔다. 마을주민들은 나무에 꽃이 필 때 위쪽에서 먼저 피면 풍년이 오고 아래쪽에서 먼저 피면 흉년이 든다는 이야기를 아직 믿고 있다. 이제는 신현동에서 농사를 짓는 가구가 거의 없지만 그래도 신현동 회화나무는 주민들의 수호신인 성황목(城隍木)이다.